ຂ່າວ

ໃນທົດສະວັດທີ່ຜ່ານມາ, ເຕັກໂນໂລຊີການຈັດລໍາດັບ gene ໄດ້ຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນການຄົ້ນຄວ້າມະເຮັງແລະການປະຕິບັດທາງດ້ານການຊ່ວຍ, ກາຍເປັນເຄື່ອງມືທີ່ສໍາຄັນທີ່ຈະເປີດເຜີຍລັກສະນະໂມເລກຸນຂອງມະເຮັງ. ຄວາມກ້າວຫນ້າໃນການວິນິດໄສໂມເລກຸນແລະການປິ່ນປົວເປົ້າຫມາຍໄດ້ສົ່ງເສີມການພັດທະນາແນວຄວາມຄິດການປິ່ນປົວຄວາມແມ່ນຍໍາ tumor ແລະໄດ້ນໍາເອົາການປ່ຽນແປງທີ່ຍິ່ງໃຫຍ່ໃນພາກສະຫນາມທັງຫມົດຂອງການວິນິດໄສ tumor ແລະການປິ່ນປົວ. ການທົດສອບພັນທຸກໍາສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອເຕືອນຄວາມສ່ຽງຕໍ່ມະເຮັງ, ນໍາພາການຕັດສິນໃຈໃນການປິ່ນປົວແລະການປະເມີນການຄາດຄະເນ, ແລະເປັນເຄື່ອງມືທີ່ສໍາຄັນເພື່ອປັບປຸງຜົນໄດ້ຮັບທາງດ້ານການຊ່ວຍຂອງຄົນເຈັບ. ທີ່ນີ້, ພວກເຮົາສະຫຼຸບບົດຄວາມທີ່ຜ່ານມາຈັດພີມມາຢູ່ໃນ CA Cancer J Clin, JCO, Ann Oncol ແລະວາລະສານອື່ນໆເພື່ອທົບທວນຄືນຄໍາຮ້ອງສະຫມັກຂອງການທົດສອບພັນທຸກໍາໃນການວິນິດໄສແລະການປິ່ນປົວມະເຮັງ.

ການກາຍພັນ somatic ແລະການກາຍພັນຂອງເຊື້ອ. ໂດຍທົ່ວໄປ, ມະເຮັງແມ່ນເກີດມາຈາກການກາຍພັນຂອງ DNA ທີ່ສາມາດສືບທອດມາຈາກພໍ່ແມ່ (ການກາຍພັນຂອງເຊື້ອ) ຫຼືໄດ້ມາກັບອາຍຸ (ການກາຍພັນ somatic). ການກາຍພັນຂອງເຊື້ອພັນແມ່ນມີຢູ່ຕັ້ງແຕ່ເກີດ, ແລະຕົວກາຍພັນປົກກະຕິແລ້ວປະຕິບັດການກາຍພັນໃນ DNA ຂອງທຸກໆຈຸລັງໃນຮ່າງກາຍແລະສາມາດສົ່ງຕໍ່ໄປສູ່ລູກຫລານ. ການກາຍພັນຂອງ Somatic ແມ່ນໄດ້ມາໂດຍບຸກຄົນໃນຈຸລັງທີ່ບໍ່ແມ່ນເກມແລະປົກກະຕິແລ້ວບໍ່ໄດ້ຖືກຖ່າຍທອດໄປສູ່ລູກຫລານ. ທັງສອງການກາຍພັນຂອງເຊື້ອສາຍແລະ somatic ສາມາດທໍາລາຍກິດຈະກໍາປົກກະຕິຂອງຈຸລັງແລະນໍາໄປສູ່ການຫັນປ່ຽນ malignant ຂອງຈຸລັງ. ການກາຍພັນຂອງ Somatic ແມ່ນຕົວຂັບເຄື່ອນທີ່ສໍາຄັນຂອງ malignancy ແລະ biomarker ຄາດຄະເນທີ່ສຸດໃນ oncology; ແນວໃດກໍ່ຕາມ, ປະມານ 10 ຫາ 20 ເປີເຊັນຂອງຄົນເຈັບເນື້ອງອກມີການແຜ່ພັນຂອງເຊື້ອທີ່ເພີ່ມຄວາມສ່ຽງຕໍ່ການເປັນມະເຮັງຂອງເຂົາເຈົ້າຢ່າງຫຼວງຫຼາຍ, ແລະບາງການກາຍພັນເຫຼົ່ານີ້ຍັງປິ່ນປົວໄດ້.
ການກາຍພັນຂອງຜູ້ຂັບຂີ່ແລະການກາຍພັນຂອງຜູ້ໂດຍສານ. ບໍ່ແມ່ນຕົວແປ DNA ທັງຫມົດຜົນກະທົບຕໍ່ການເຮັດວຽກຂອງເຊນ; ໂດຍສະເລ່ຍ, ມັນໃຊ້ເວລາຫ້າຫາສິບເຫດການທາງພັນທຸກໍາ, ເອີ້ນວ່າ "ການກາຍພັນຂອງຕົວຂັບ," ເພື່ອເຮັດໃຫ້ເກີດການເສື່ອມສະພາບຂອງເຊນປົກກະຕິ. ການກາຍພັນຂອງຕົວຂັບມັກຈະເກີດຂື້ນໃນພັນທຸກໍາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບກິດຈະກໍາຊີວິດຂອງເຊນ, ເຊັ່ນ: ພັນທຸ ກຳ ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການເຕີບໃຫຍ່ຂອງເຊນ, ການສ້ອມແປງ DNA, ການຄວບຄຸມວົງຈອນຂອງເຊນແລະຂະບວນການຊີວິດອື່ນໆ, ແລະມີທ່າແຮງທີ່ຈະໃຊ້ເປັນເປົ້າຫມາຍການປິ່ນປົວ. ແນວໃດກໍ່ຕາມ, ຈໍານວນການກາຍພັນທັງໝົດຂອງມະເຮັງຊະນິດໃດກໍ່ມີຈໍານວນຫຼວງຫຼາຍ, ຕັ້ງແຕ່ສອງສາມພັນຄົນໃນມະເຮັງເຕົ້ານົມບາງຊະນິດເຖິງຫຼາຍກວ່າ 100,000 ຄົນໃນບາງມະເຮັງລໍາໃສ້ ແລະ endometrial ທີ່ມີຄວາມປ່ຽນແປງສູງ. ການກາຍພັນສ່ວນໃຫຍ່ບໍ່ມີຄວາມສໍາຄັນທາງຊີວະວິທະຍາ ຫຼື ຈໍາກັດ, ເຖິງແມ່ນວ່າການກາຍພັນຈະເກີດຂຶ້ນໃນພາກພື້ນລະຫັດ, ເຫດການການກາຍພັນທີ່ບໍ່ສໍາຄັນດັ່ງກ່າວຖືກເອີ້ນວ່າ "ການກາຍພັນຂອງຜູ້ໂດຍສານ". ຖ້າຕົວແປຂອງ gene ໃນປະເພດເນື້ອງອກສະເພາະໃດຫນຶ່ງຄາດຄະເນການຕອບສະຫນອງຂອງຕົນຕໍ່ກັບຫຼືຄວາມຕ້ານທານຕໍ່ການປິ່ນປົວ, variant ແມ່ນພິຈາລະນາທາງດ້ານການຊ່ວຍ.
Oncogenes ແລະ genes ສະກັດກັ້ນ tumor. genes ທີ່ມີການປ່ຽນແປງເລື້ອຍໆໃນມະເຮັງສາມາດແບ່ງອອກເປັນສອງປະເພດ, oncogenes ແລະ tumor suppressor genes. ໃນຈຸລັງປົກກະຕິ, ທາດໂປຼຕີນທີ່ຖືກເຂົ້າລະຫັດໂດຍ oncogenes ສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນມີບົດບາດໃນການສົ່ງເສີມການຂະຫຍາຍຈຸລັງແລະຍັບຍັ້ງ apoptosis ຂອງເຊນ, ໃນຂະນະທີ່ທາດໂປຼຕີນທີ່ຖືກເຂົ້າລະຫັດໂດຍ oncosuppressor genes ສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນຮັບຜິດຊອບໃນການຄວບຄຸມການແບ່ງຈຸລັງໃນທາງລົບເພື່ອຮັກສາການເຮັດວຽກຂອງເຊນປົກກະຕິ. ໃນຂະບວນການຫັນປ່ຽນ malignant, ການກາຍພັນຂອງ genomic ນໍາໄປສູ່ການເພີ່ມປະສິດທິພາບຂອງກິດຈະກໍາ oncogene ແລະການຫຼຸດລົງຫຼືການສູນເສຍກິດຈະກໍາ gene oncosuppressor.
ການປ່ຽນແປງຂະຫນາດນ້ອຍແລະການປ່ຽນແປງໂຄງສ້າງ. ນີ້ແມ່ນສອງປະເພດຕົ້ນຕໍຂອງການກາຍພັນໃນ genome. ຕົວແປຂະໜາດນ້ອຍປ່ຽນແປງ DNA ໂດຍການປ່ຽນແປງ, ລຶບ ຫຼືເພີ່ມຖານຈຳນວນໜ້ອຍ, ລວມທັງການໃສ່ຖານ, ການລຶບ, frameshift, ເລີ່ມການສູນເສຍ codon, ຢຸດການກາຍພັນຂອງ codon loss, ແລະອື່ນໆ. ການປ່ຽນແປງທາງໂຄງສ້າງແມ່ນການຈັດລຽງຂອງ genome ຂະຫນາດໃຫຍ່, ກ່ຽວຂ້ອງກັບສ່ວນຂອງ gene ທີ່ມີຂະຫນາດຈາກສອງສາມພັນຖານ chromosome, ລວມທັງການປ່ຽນແປງຂອງ chromosome ສ່ວນໃຫຍ່. ການລຶບ, ການຊໍ້າຊ້ອນ, ການປີ້ນ ຫຼືການຍົກຍ້າຍ. ການກາຍພັນເຫຼົ່ານີ້ອາດຈະເຮັດໃຫ້ເກີດການຫຼຸດຜ່ອນຫຼືປັບປຸງການເຮັດວຽກຂອງທາດໂປຼຕີນ. ນອກເຫນືອຈາກການປ່ຽນແປງໃນລະດັບຂອງພັນທຸກໍາຂອງບຸກຄົນ, ລາຍເຊັນຂອງ genomic ຍັງເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງບົດລາຍງານການຈັດລໍາດັບທາງດ້ານຄລີນິກ. ລາຍເຊັນຂອງພັນທຸກໍາສາມາດເຫັນໄດ້ວ່າເປັນຮູບແບບທີ່ສັບສົນຂອງການປ່ຽນແປງຂະຫນາດນ້ອຍແລະ / ຫຼືໂຄງສ້າງ, ລວມທັງ tumor mutation load (TMB), microsatellite instability (MSI), ແລະຂໍ້ບົກພ່ອງຂອງ recombination homologous.

ການກາຍພັນຂອງ clonal ແລະ subclonal mutation. ການກາຍພັນຂອງ clonal ແມ່ນມີຢູ່ໃນຈຸລັງ tumor ທັງຫມົດ, ມີຢູ່ໃນການວິນິດໄສ, ແລະຍັງຄົງຢູ່ຫຼັງຈາກຄວາມກ້າວຫນ້າຂອງການປິ່ນປົວ. ດັ່ງນັ້ນ, ການກາຍພັນຂອງ clonal ມີທ່າແຮງທີ່ຈະຖືກນໍາໃຊ້ເປັນເປົ້າຫມາຍການປິ່ນປົວ tumor. ການກາຍພັນຂອງ subclonal ແມ່ນມີຢູ່ໃນພຽງແຕ່ຊຸດຍ່ອຍຂອງຈຸລັງມະເຮັງແລະອາດຈະຖືກກວດພົບໃນຕອນເລີ່ມຕົ້ນຂອງການວິນິດໄສ, ແຕ່ຫາຍໄປດ້ວຍການເປັນຄືນໃຫມ່ຕໍ່ມາຫຼືປາກົດພຽງແຕ່ຫຼັງຈາກການປິ່ນປົວ. heterogeneity ມະເຮັງຫມາຍເຖິງການປະກົດຕົວຂອງການກາຍພັນຂອງ subclonal ຫຼາຍຢູ່ໃນມະເຮັງດຽວ. ໂດຍສະເພາະ, ສ່ວນໃຫຍ່ຂອງການກາຍພັນທີ່ສໍາຄັນທາງດ້ານຄລີນິກໃນທຸກຊະນິດຂອງມະເຮັງທົ່ວໄປແມ່ນການກາຍພັນຂອງ clonal ແລະຍັງຄົງຄົງຢູ່ຕະຫຼອດການເປັນມະເຮັງ. ຄວາມຕ້ານທານ, ເຊິ່ງມັກຈະຖືກໄກ່ເກ່ຍໂດຍ subclones, ອາດຈະບໍ່ຖືກກວດພົບໃນເວລາທີ່ການວິນິດໄສແຕ່ປາກົດເມື່ອມັນ relapses ຫຼັງຈາກການປິ່ນປົວ.

ເຕັກນິກພື້ນເມືອງ FISH ຫຼື cell karyotype ແມ່ນໃຊ້ເພື່ອກວດຫາການປ່ຽນແປງໃນລະດັບໂຄໂມໂຊມ. FISH ສາມາດໃຊ້ເພື່ອກວດຫາ gene fusions, deletions, and amplifications, ແລະຖືວ່າເປັນ "ມາດຕະຖານທອງ" ສໍາລັບການກວດສອບຕົວແປດັ່ງກ່າວ, ມີຄວາມແມ່ນຍໍາສູງ ແລະຄວາມອ່ອນໄຫວສູງ ແຕ່ມີຂອບເຂດຈໍາກັດ. ໃນບາງພະຍາດທາງເລືອດ, ໂດຍສະເພາະ leukemia ສ້ວຍແຫຼມ, karyotyping ຍັງຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອນໍາພາການວິນິດໄສແລະການຄາດຄະເນ, ແຕ່ເຕັກນິກນີ້ຄ່ອຍໆຖືກທົດແທນໂດຍການວິເຄາະໂມເລກຸນເປົ້າຫມາຍເຊັ່ນ FISH, WGS, ແລະ NGS.
ການປ່ຽນແປງໃນພັນທຸກໍາຂອງບຸກຄົນສາມາດກວດພົບໄດ້ໂດຍ PCR, ທັງ PCR ໃນເວລາທີ່ແທ້ຈິງແລະ PCR ຫຼຸດລົງ. ເຕັກນິກເຫຼົ່ານີ້ມີຄວາມອ່ອນໄຫວສູງ, ໂດຍສະເພາະແມ່ນເຫມາະສົມສໍາລັບການກວດພົບແລະການຕິດຕາມຂອງ lesions ທີ່ຕົກຄ້າງຂະຫນາດນ້ອຍ, ແລະສາມາດໄດ້ຮັບຜົນໄດ້ຮັບໃນໄລຍະເວລາທີ່ຂ້ອນຂ້າງສັ້ນ, ຂໍ້ເສຍແມ່ນວ່າໄລຍະການກວດສອບແມ່ນຈໍາກັດ (ປົກກະຕິແລ້ວພຽງແຕ່ກວດພົບການກາຍພັນໃນຫນຶ່ງຫຼືສອງສາມພັນທຸກໍາ), ແລະຄວາມສາມາດໃນການທົດສອບຫຼາຍແມ່ນຈໍາກັດ.
Immunohistochemistry (IHC) ເປັນເຄື່ອງມືຕິດຕາມກວດກາທາດໂປຼຕີນທີ່ຖືກນໍາໃຊ້ໂດຍທົ່ວໄປເພື່ອກວດພົບການສະແດງອອກຂອງ biomarkers ເຊັ່ນ ERBB2 (HER2) ແລະ receptors estrogen. IHC ຍັງສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອກວດຫາໂປຣຕີນທີ່ກາຍພັນສະເພາະ (ເຊັ່ນ: BRAF V600E) ແລະ gene fusions ສະເພາະ (ເຊັ່ນ: ALK fusions). ປະໂຫຍດຂອງ IHC ແມ່ນວ່າມັນສາມາດປະສົມປະສານໄດ້ງ່າຍໃນຂະບວນການວິເຄາະເນື້ອເຍື່ອປົກກະຕິ, ດັ່ງນັ້ນມັນສາມາດຖືກລວມເຂົ້າກັບການທົດສອບອື່ນໆ. ນອກຈາກນັ້ນ, IHC ສາມາດສະຫນອງຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບການທ້ອງຖິ່ນຂອງທາດໂປຼຕີນຈາກ subcellular. ຂໍ້ເສຍແມ່ນຄວາມສາມາດຂະຫຍາຍໄດ້ທີ່ຈຳກັດ ແລະ ຄວາມຕ້ອງການຂອງອົງກອນສູງ.
ການຈັດລໍາດັບຮຸ່ນທີສອງ (NGS) NGS ໃຊ້ເຕັກນິກການຈັດລໍາດັບຂະຫນານທີ່ມີຄວາມໄວສູງເພື່ອກວດພົບການປ່ຽນແປງໃນລະດັບ DNA ແລະ / ຫຼື RNA. ເຕັກນິກນີ້ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອຈັດລໍາດັບທັງ genome ທັງຫມົດ (WGS) ແລະພາກພື້ນ gene ມີຄວາມສົນໃຈ. WGS ສະຫນອງຂໍ້ມູນການກາຍພັນຂອງ genomic ທີ່ສົມບູນແບບທີ່ສຸດ, ແຕ່ມີອຸປະສັກຫຼາຍຕໍ່ກັບຄໍາຮ້ອງສະຫມັກທາງດ້ານການຊ່ວຍຂອງມັນ, ລວມທັງຄວາມຕ້ອງການສໍາລັບຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອ tumor ສົດ (WGS ຍັງບໍ່ທັນເຫມາະສົມສໍາລັບການວິເຄາະຕົວຢ່າງ formalin-immobilized) ແລະຄ່າໃຊ້ຈ່າຍສູງ.
ການຈັດລໍາດັບ NGS ເປົ້າໝາຍລວມມີການຈັດລໍາດັບ exon ທັງໝົດ ແລະແຜງ gene ເປົ້າໝາຍ. ການທົດສອບເຫຼົ່ານີ້ເສີມສ້າງຂົງເຂດທີ່ມີຄວາມສົນໃຈໂດຍການຂະຫຍາຍ DNA ຫຼື PCR ຂະຫຍາຍ, ດັ່ງນັ້ນຈຶ່ງຈໍາກັດຈໍານວນລໍາດັບທີ່ຕ້ອງການ (exome ທັງຫມົດເຮັດໃຫ້ເຖິງ 1 ຫາ 2 ສ່ວນຮ້ອຍຂອງ genome, ແລະແມ້ກະທັ້ງຫມູ່ຄະນະຂະຫນາດໃຫຍ່ທີ່ມີ 500 genes ມີພຽງແຕ່ 0.1 ສ່ວນຮ້ອຍຂອງ genome). ເຖິງແມ່ນວ່າການຈັດລໍາດັບ exon ທັງຫມົດປະຕິບັດໄດ້ດີໃນເນື້ອເຍື່ອຄົງທີ່ formalin, ຄ່າໃຊ້ຈ່າຍຂອງມັນຍັງຄົງສູງ. ການປະສົມປະສານຂອງ gene ເປົ້າຫມາຍແມ່ນຂ້ອນຂ້າງປະຫຍັດແລະອະນຸຍາດໃຫ້ມີຄວາມຍືດຫຍຸ່ນໃນການເລືອກ genes ເພື່ອທົດສອບ. ນອກຈາກນັ້ນ, ການແຜ່ກະຈາຍ DNA ຟຣີ (cfDNA) ກໍາລັງອອກມາເປັນທາງເລືອກໃຫມ່ສໍາລັບການວິເຄາະ genomic ຂອງຄົນເຈັບມະເຮັງ, ເອີ້ນວ່າ biopsies ແຫຼວ. ທັງຈຸລັງມະເຮັງແລະຈຸລັງປົກກະຕິສາມາດປ່ອຍ DNA ເຂົ້າໄປໃນກະແສເລືອດ, ແລະ DNA ທີ່ຫຼົ່ນລົງຈາກຈຸລັງມະເຮັງແມ່ນເອີ້ນວ່າ circulating tumor DNA (ctDNA), ເຊິ່ງສາມາດວິເຄາະເພື່ອກວດຫາການກາຍພັນທີ່ອາດຈະເກີດຂື້ນໃນຈຸລັງ tumor.
ທາງເລືອກຂອງການທົດສອບແມ່ນຂຶ້ນກັບບັນຫາທາງດ້ານຄລີນິກສະເພາະທີ່ຈະແກ້ໄຂ. ສ່ວນໃຫຍ່ຂອງ biomarkers ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການປິ່ນປົວທີ່ໄດ້ຮັບການອະນຸມັດສາມາດກວດພົບໄດ້ໂດຍ FISH, IHC, ແລະເຕັກນິກ PCR. ວິທີການເຫຼົ່ານີ້ແມ່ນສົມເຫດສົມຜົນສໍາລັບການຊອກຄົ້ນຫາ biomarkers ຈໍານວນຂະຫນາດນ້ອຍ, ແຕ່ພວກເຂົາບໍ່ໄດ້ປັບປຸງປະສິດທິພາບຂອງການກວດສອບດ້ວຍການເພີ່ມຂຶ້ນໂດຍຜ່ານການ, ແລະຖ້າຫາກວ່າ biomarkers ຫຼາຍເກີນໄປໄດ້ຖືກກວດພົບ, ອາດຈະບໍ່ມີເນື້ອເຍື່ອພຽງພໍສໍາລັບການກວດພົບ. ໃນບາງມະເຮັງສະເພາະ, ເຊັ່ນ: ມະເຮັງປອດ, ບ່ອນທີ່ຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອແມ່ນຍາກທີ່ຈະໄດ້ຮັບແລະມີ biomarkers ຫຼາຍເພື່ອທົດສອບ, ການນໍາໃຊ້ NGS ເປັນທາງເລືອກທີ່ດີກວ່າ. ສະຫຼຸບແລ້ວ, ທາງເລືອກຂອງການວິເຄາະແມ່ນຂຶ້ນກັບຈໍານວນຂອງ biomarkers ທີ່ຈະທົດສອບສໍາລັບຄົນເຈັບແຕ່ລະຄົນແລະຈໍານວນຄົນເຈັບທີ່ຈະທົດສອບ biomarker ໄດ້. ໃນບາງກໍລະນີ, ການນໍາໃຊ້ IHC / FISH ແມ່ນພຽງພໍ, ໂດຍສະເພາະໃນເວລາທີ່ເປົ້າຫມາຍໄດ້ຖືກກໍານົດ, ເຊັ່ນ: ການກວດຫາ estrogen receptors, progesterone receptors, ແລະ ERBB2 ໃນຄົນເຈັບມະເຮັງເຕົ້ານົມ. ຖ້າການຄົ້ນພົບການກາຍພັນຂອງພັນທຸກໍາຢ່າງກວ້າງຂວາງແລະການຄົ້ນຫາເປົ້າຫມາຍການປິ່ນປົວທີ່ເປັນໄປໄດ້ແມ່ນຕ້ອງການ, NGS ແມ່ນມີການຈັດຕັ້ງຫຼາຍແລະປະຫຍັດຄ່າໃຊ້ຈ່າຍ. ນອກຈາກນັ້ນ, NGS ອາດຈະຖືກພິຈາລະນາໃນກໍລະນີທີ່ຜົນຂອງ IHC/FISH ມີຄວາມໜ້າສົງໄສ ຫຼື ສະຫຼຸບບໍ່ໄດ້.

ຂໍ້ແນະນໍາທີ່ແຕກຕ່າງກັນໃຫ້ຄໍາແນະນໍາທີ່ຄົນເຈັບຄວນຈະມີສິດໄດ້ຮັບການທົດສອບທາງພັນທຸກໍາ. ໃນປີ 2020, ESMO Precision Medicine Working Group ໄດ້ອອກຄໍາແນະນໍາການທົດສອບ NGS ທໍາອິດສໍາລັບຄົນເຈັບທີ່ເປັນມະເຮັງແບບພິເສດ, ແນະນໍາການທົດສອບ NGS ປົກກະຕິສໍາລັບມະເຮັງປອດທີ່ບໍ່ແມ່ນຈຸລັງຂະຫນາດນ້ອຍ, ມະເຮັງ prostate, ມະເຮັງລໍາໄສ້ໃຫຍ່, ມະເຮັງທໍ່ນໍ້າບີ, ແລະຕົວຢ່າງເນື້ອງອກຂອງມະເຮັງເຕົ້ານົມ, ແລະໃນປີ 2024, ການສຶກສາແນະນໍາຂອງເນື້ອງອກທີ່ຫາຍາກ, ESMO. ເຊັ່ນ: tumors stromal gastrointestinal, sarcomas, ມະເຮັງ thyroid ແລະມະເຮັງຂອງຕົ້ນກໍາເນີດທີ່ບໍ່ຮູ້.
ໃນປີ 2022, ຄວາມຄິດເຫັນທາງດ້ານການຊ່ວຍຂອງ ASCO ກ່ຽວກັບການທົດສອບ genome somatic ໃນຄົນເຈັບທີ່ເປັນມະເຮັງ metastatic ຫຼືກ້າວຫນ້າທາງດ້ານການລະບຸວ່າຖ້າຫາກວ່າການປິ່ນປົວດ້ວຍ biomarker ໄດ້ຖືກອະນຸມັດໃນຄົນເຈັບທີ່ມີເນື້ອງອກແຂງ metastatic ຫຼືກ້າວຫນ້າ, ການທົດສອບພັນທຸກໍາແມ່ນແນະນໍາໃຫ້ຄົນເຈັບເຫຼົ່ານີ້. ສໍາລັບຕົວຢ່າງ, ການທົດສອບ genomic ຄວນໄດ້ຮັບການປະຕິບັດໃນຄົນເຈັບທີ່ມີ melanoma metastatic ເພື່ອກວດຫາການກາຍພັນຂອງ BRAF V600E, ເນື່ອງຈາກວ່າ RAF ແລະ MEK inhibitors ໄດ້ຮັບການອະນຸມັດສໍາລັບການຊີ້ບອກນີ້. ນອກຈາກນັ້ນ, ການທົດສອບທາງພັນທຸກໍາຍັງຄວນໄດ້ຮັບການປະຕິບັດຖ້າມີເຄື່ອງຫມາຍການຕໍ່ຕ້ານຢ່າງຈະແຈ້ງສໍາລັບຢາທີ່ຈະປະຕິບັດໃຫ້ຄົນເຈັບ. ສໍາລັບຕົວຢ່າງ, Egfrmab ແມ່ນບໍ່ມີປະສິດຕິຜົນໃນ KRAS ມະເຮັງ colorectal mutant. ເມື່ອພິຈາລະນາຄວາມເຫມາະສົມຂອງຄົນເຈັບສໍາລັບການຈັດລໍາດັບ gene, ສະຖານະການທາງດ້ານຮ່າງກາຍຂອງຄົນເຈັບ, comorbidities, ແລະຂັ້ນຕອນ tumor ຄວນໄດ້ຮັບການປະສົມປະສານ, ເນື່ອງຈາກວ່າຊຸດຂອງຂັ້ນຕອນທີ່ຈໍາເປັນສໍາລັບການຈັດລໍາດັບ genome, ລວມທັງການຍິນຍອມຂອງຄົນເຈັບ, ການປຸງແຕ່ງຫ້ອງທົດລອງ, ແລະການວິເຄາະຜົນລໍາດັບ, ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ຄົນເຈັບມີຄວາມສາມາດທາງດ້ານຮ່າງກາຍທີ່ພຽງພໍແລະອາຍຸຍືນ.
ນອກເຫນືອຈາກການກາຍພັນ somatic, ມະເຮັງບາງຊະນິດຍັງຄວນໄດ້ຮັບການທົດສອບສໍາລັບເຊື້ອສາຍເຊື້ອສາຍ. ການທົດສອບການກາຍພັນຂອງເຊື້ອສາຍອາດມີອິດທິພົນຕໍ່ການຕັດສິນໃຈໃນການປິ່ນປົວມະເຮັງເຊັ່ນ: ການກາຍພັນຂອງ BRCA1 ແລະ BRCA2 ໃນມະເຮັງເຕົ້ານົມ, ຮວຍໄຂ່, ຕ່ອມລູກໝາກ ແລະມະເຮັງຕ່ອມລູກໝາກ. ການກາຍພັນຂອງເຊື້ອສາຍອາດຈະສົ່ງຜົນກະທົບຕໍ່ການກວດ ແລະປ້ອງກັນມະເຮັງໃນອະນາຄົດໃນຄົນເຈັບ. ຄົນເຈັບທີ່ມີທ່າແຮງທີ່ເຫມາະສົມສໍາລັບການທົດສອບການກາຍພັນຂອງເຊື້ອແມ່ນຕ້ອງຕອບສະຫນອງເງື່ອນໄຂບາງຢ່າງ, ເຊິ່ງກ່ຽວຂ້ອງກັບປັດໃຈເຊັ່ນ: ປະຫວັດຄອບຄົວຂອງມະເຮັງ, ອາຍຸໃນການວິນິດໄສ, ແລະປະເພດຂອງມະເຮັງ. ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ຄົນເຈັບຈໍານວນຫຼາຍ (ເຖິງ 50%) ທີ່ມີການກາຍພັນຂອງເຊື້ອພະຍາດຢູ່ໃນສາຍເຊື້ອພະຍາດບໍ່ກົງກັບເງື່ອນໄຂແບບດັ້ງເດີມສໍາລັບການທົດສອບການກາຍພັນຂອງເຊື້ອພະຍາດໂດຍອີງໃສ່ປະຫວັດຄອບຄົວ. ດັ່ງນັ້ນ, ເພື່ອເຮັດໃຫ້ການກໍານົດຕົວແຜ່ພັນໄດ້ສູງສຸດ, ເຄືອຂ່າຍມະເຮັງທີ່ສົມບູນແບບແຫ່ງຊາດ (NCCN) ແນະນໍາໃຫ້ຄົນເຈັບທັງໝົດ ຫຼືສ່ວນຫຼາຍທີ່ເປັນມະເຮັງເຕົ້ານົມ, ຮວຍໄຂ່, endometrial, pancreatic, ລໍາໄສ້ໃຫຍ່, ມະເຮັງລໍາໃສ້, ຫຼື prostate ສໍາລັບການກາຍພັນຂອງເຊື້ອສາຍ.
ກ່ຽວກັບໄລຍະເວລາຂອງການທົດສອບພັນທຸກໍາ, ເນື່ອງຈາກວ່າສ່ວນໃຫຍ່ຂອງການກາຍພັນທີ່ສໍາຄັນທາງດ້ານຄລີນິກແມ່ນ clonal ແລະຂ້ອນຂ້າງຄົງທີ່ໃນໄລຍະການເປັນມະເຮັງ, ມັນສົມເຫດສົມຜົນທີ່ຈະເຮັດການທົດສອບພັນທຸກໍາໃນຄົນເຈັບໃນເວລາທີ່ການບົ່ງມະຕິຂອງມະເຮັງກ້າວຫນ້າ. ສໍາລັບການທົດສອບທາງພັນທຸກໍາຕໍ່ມາ, ໂດຍສະເພາະຫຼັງຈາກການປິ່ນປົວດ້ວຍເປົ້າຫມາຍໂມເລກຸນ, ການທົດສອບ ctDNA ແມ່ນມີປະໂຫຍດຫຼາຍກ່ວາ DNA ຂອງເນື້ອເຍື່ອຂອງເນື້ອງອກ, ເພາະວ່າ DNA ເລືອດສາມາດບັນຈຸ DNA ຈາກເນື້ອງອກທັງຫມົດ, ເຊິ່ງເຮັດໃຫ້ການໄດ້ຮັບຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບ tumor heterogeneity.
ການວິເຄາະ ctDNA ຫຼັງຈາກການປິ່ນປົວອາດຈະສາມາດຄາດຄະເນການຕອບສະຫນອງຂອງເນື້ອງອກໃນການປິ່ນປົວແລະກໍານົດຄວາມຄືບຫນ້າຂອງພະຍາດໄວກວ່າວິທີການຮູບພາບມາດຕະຖານ. ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ໂປໂຕຄອນສໍາລັບການນໍາໃຊ້ຂໍ້ມູນເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອນໍາພາການຕັດສິນໃຈໃນການປິ່ນປົວບໍ່ໄດ້ຖືກສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນ, ແລະການວິເຄາະ ctDNA ບໍ່ໄດ້ຖືກແນະນໍາເວັ້ນເສຍແຕ່ວ່າຢູ່ໃນການທົດລອງທາງດ້ານການຊ່ວຍ. ctDNA ຍັງສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອປະເມີນ lesions ຂະຫນາດນ້ອຍຫຼັງຈາກການຜ່າຕັດ tumor radical. ການທົດສອບ ctDNA ຫຼັງຈາກການຜ່າຕັດແມ່ນການຄາດຄະເນທີ່ເຂັ້ມແຂງຂອງຄວາມຄືບຫນ້າຂອງພະຍາດຕໍ່ໄປແລະອາດຈະຊ່ວຍກໍານົດວ່າຄົນເຈັບຈະໄດ້ຮັບຜົນປະໂຫຍດຈາກການປິ່ນປົວດ້ວຍທາງເຄມີບໍາບັດ, ແຕ່ມັນຍັງບໍ່ໄດ້ແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ ctDNA ພາຍນອກຂອງການທົດລອງທາງດ້ານການຊ່ວຍເພື່ອນໍາພາການຕັດສິນໃຈທາງເຄມີບໍາບັດ adjuvant.

ການປຸງແຕ່ງຂໍ້ມູນ ຂັ້ນຕອນທໍາອິດໃນການຈັດລໍາດັບ genome ແມ່ນເພື່ອສະກັດ DNA ຈາກຕົວຢ່າງຂອງຄົນເຈັບ, ກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ, ແລະສ້າງຂໍ້ມູນລໍາດັບດິບ. ຂໍ້ມູນວັດຖຸດິບຮຽກຮ້ອງໃຫ້ມີການປຸງແຕ່ງຕື່ມອີກ, ລວມທັງການກັ່ນຕອງຂໍ້ມູນທີ່ມີຄຸນນະພາບຕ່ໍາ, ປຽບທຽບກັບ genome ອ້າງອີງ, ການກໍານົດປະເພດຂອງການກາຍພັນທີ່ແຕກຕ່າງກັນໂດຍຜ່ານວິທີການວິເຄາະທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ການກໍານົດຜົນກະທົບຂອງການກາຍພັນເຫຼົ່ານີ້ຕໍ່ການແປທາດໂປຼຕີນ, ແລະການກັ່ນຕອງການກາຍພັນຂອງເຊື້ອສາຍ.
ຄໍາອະທິບາຍກ່ຽວກັບພັນທຸກໍາຂອງໄດເວີຖືກອອກແບບມາເພື່ອຈໍາແນກການກາຍພັນຂອງຜູ້ຂັບຂີ່ແລະຜູ້ໂດຍສານ. ການກາຍພັນຂອງຜູ້ຂັບຂີ່ນໍາໄປສູ່ການສູນເສຍຫຼືການປັບປຸງກິດຈະກໍາຂອງ gene ສະກັດກັ້ນ tumor. ການປ່ຽນແປງຂະຫນາດນ້ອຍທີ່ນໍາໄປສູ່ການ inactivation ຂອງ tumor suppressor genes ປະກອບມີການກາຍພັນທີ່ບໍ່ມີເຫດຜົນ, ການກາຍພັນຂອງ frameshift, ແລະການກາຍພັນຂອງສະຖານທີ່ splicing ທີ່ສໍາຄັນ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບການເລີ່ມຕົ້ນການລຶບ codon ເລື້ອຍໆຫນ້ອຍ, ຢຸດການລຶບ codon, ແລະການກາຍພັນທີ່ຫຼາກຫຼາຍຂອງການແຊກຊຶມ / ລຶບ intro. ນອກຈາກນັ້ນ, ການກາຍພັນຂອງ missense ແລະການກາຍພັນຂອງ introduction / ການລົບຂະຫນາດນ້ອຍຍັງສາມາດນໍາໄປສູ່ການສູນເສຍກິດຈະກໍາຂອງ tumor suppressor gene ໃນເວລາທີ່ຜົນກະທົບຕໍ່ໂດເມນທີ່ສໍາຄັນ. ຕົວແປໂຄງສ້າງທີ່ນໍາໄປສູ່ການສູນເສຍກິດຈະກໍາ gene suppressor tumor ປະກອບມີການລຶບລ້າງ gene ບາງສ່ວນຫຼືຄົບຖ້ວນແລະຕົວແປຂອງ genomic ອື່ນໆທີ່ນໍາໄປສູ່ການທໍາລາຍກອບການອ່ານ gene. ການປ່ຽນແປງຂະຫນາດນ້ອຍທີ່ນໍາໄປສູ່ຫນ້າທີ່ປັບປຸງຂອງ oncogenes ປະກອບມີການກາຍພັນທີ່ຜິດພາດແລະການແຊກ / ການລຶບ introduction ເປັນບາງໂອກາດທີ່ເປົ້າຫມາຍໂດເມນທີ່ເປັນປະໂຫຍດຂອງທາດໂປຼຕີນທີ່ສໍາຄັນ. ໃນກໍລະນີທີ່ຫາຍາກ, ການຕັດທາດໂປຼຕີນຫຼືການປ່ຽນແປງສະຖານທີ່ splicing ສາມາດນໍາໄປສູ່ການກະຕຸ້ນຂອງ oncogenes. ການປ່ຽນແປງຂອງໂຄງສ້າງທີ່ນໍາໄປສູ່ການກະຕຸ້ນ oncogene ປະກອບມີ gene fusion, gene deletion, ແລະການຊໍ້າຊ້ອນຂອງ gene.
ການຕີຄວາມຫມາຍທາງດ້ານຄລີນິກຂອງການປ່ຽນແປງທາງພັນທຸກໍາປະເມີນຄວາມສໍາຄັນທາງດ້ານຄລີນິກຂອງການກາຍພັນທີ່ຖືກກໍານົດ, ເຊັ່ນ: ມູນຄ່າການວິນິດໄສ, ການຄາດຄະເນ, ຫຼືການປິ່ນປົວທີ່ເປັນໄປໄດ້. ມີລະບົບການໃຫ້ຄະແນນທີ່ອີງໃສ່ຫຼັກຖານຫຼາຍອັນທີ່ສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອນໍາພາການຕີຄວາມຫມາຍທາງດ້ານຄລີນິກຂອງການປ່ຽນແປງທາງພັນທຸກໍາ.
Memorial Sloan-Kettering Cancer Center's Precision Medicine Oncology Database (OncoKB) ຈັດປະເພດພັນທຸກໍາເປັນສີ່ລະດັບໂດຍອີງໃສ່ມູນຄ່າຄາດຄະເນຂອງເຂົາເຈົ້າສໍາລັບການນໍາໃຊ້ຢາ: ລະດັບ 1/2, FDA ອະນຸມັດ, ຫຼື biomarkers ມາດຕະຖານທາງດ້ານຄລີນິກທີ່ຄາດຄະເນການຕອບສະຫນອງຂອງຕົວຊີ້ບອກສະເພາະກັບຢາທີ່ໄດ້ຮັບການອະນຸມັດ; ລະດັບ 3, biomarkers ທີ່ໄດ້ຮັບການອະນຸມັດຈາກ FDA ຫຼືບໍ່ໄດ້ຮັບການອະນຸມັດທີ່ຄາດຄະເນການຕອບສະຫນອງຕໍ່ຢາເປົ້າຫມາຍໃຫມ່ທີ່ສະແດງໃຫ້ເຫັນຄໍາສັນຍາໃນການທົດລອງທາງດ້ານການຊ່ວຍ, ແລະລະດັບ 4, biomarkers ທີ່ບໍ່ແມ່ນ FDA ອະນຸມັດທີ່ຄາດຄະເນການຕອບສະຫນອງຕໍ່ຢາເປົ້າຫມາຍໃຫມ່ທີ່ໄດ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນຫຼັກຖານທາງຊີວະພາບທີ່ຫນ້າເຊື່ອຖືໃນການທົດລອງທາງດ້ານການຊ່ວຍ. ກຸ່ມຍ່ອຍທີຫ້າທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຕໍ່ຕ້ານການປິ່ນປົວໄດ້ຖືກເພີ່ມ.
The American Society for Molecular Pathology (AMP)/American Society of Clinical Oncology (ASCO)/College of American Pathologists (CAP) ຄໍາແນະນໍາສໍາລັບການຕີຄວາມຫມາຍຂອງການປ່ຽນແປງ somatic ແບ່ງການປ່ຽນແປງ somatic ເປັນສີ່ປະເພດ: ຊັ້ນຮຽນທີ I, ມີຄວາມສໍາຄັນທາງດ້ານຄລີນິກທີ່ເຂັ້ມແຂງ; ຊັ້ນຮຽນທີ II, ມີຄວາມສໍາຄັນທາງດ້ານການຊ່ວຍ; ຊັ້ນຮຽນທີ III, ບໍ່ຮູ້ຄວາມສໍາຄັນທາງດ້ານຄລີນິກ; ຊັ້ນ IV, ບໍ່ຮູ້ວ່າມີຄວາມສໍາຄັນທາງດ້ານຄລີນິກ. ສະເພາະຕົວແປລະດັບ I ແລະ II ແມ່ນມີຄຸນຄ່າສໍາລັບການຕັດສິນໃຈການປິ່ນປົວ.
ລະດັບການປະຕິບັດທາງດ້ານຄລີນິກເປົ້າໝາຍໂມເລກຸນຂອງ ESMO (ESCAT) ແບ່ງປະເພດພັນທຸກໍາອອກເປັນ 6 ລະດັບ: ລະດັບ I, ເປົ້າໝາຍທີ່ເໝາະສົມກັບການນຳໃຊ້ເປັນປົກກະຕິ; ໄລຍະ II, ເປົ້າຫມາຍທີ່ຍັງໄດ້ຮັບການສຶກສາ, ມີແນວໂນ້ມທີ່ຈະຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອກວດກາເບິ່ງປະຊາກອນຄົນເຈັບທີ່ສາມາດໄດ້ຮັບຜົນປະໂຫຍດຈາກຢາເປົ້າຫມາຍດັ່ງກ່າວ, ແຕ່ຕ້ອງການຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມເພື່ອສະຫນັບສະຫນູນມັນ. ຊັ້ນຮຽນທີ III, ຊະນິດພັນທຸກໍາທີ່ມີຈຸດປະສົງທີ່ໄດ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນຜົນປະໂຫຍດທາງດ້ານຄລີນິກໃນຊະນິດມະເຮັງອື່ນໆ; ຊັ້ນຮຽນທີ IV, ສະເພາະຕົວແປ genes ເປົ້າຫມາຍທີ່ສະຫນັບສະຫນູນໂດຍຫຼັກຖານ preclinical; ໃນຊັ້ນຮຽນທີ V, ມີຫຼັກຖານເພື່ອສະຫນັບສະຫນູນຄວາມສໍາຄັນທາງດ້ານຄລີນິກຂອງເປົ້າຫມາຍການກາຍພັນ, ແຕ່ການປິ່ນປົວດ້ວຍຢາດຽວກັບເປົ້າຫມາຍບໍ່ໄດ້ຂະຫຍາຍການຢູ່ລອດ, ຫຼືຍຸດທະສາດການປິ່ນປົວແບບປະສົມປະສານສາມາດຖືກຮັບຮອງເອົາ; ຊັ້ນຮຽນທີ X, ການຂາດມູນຄ່າທາງດ້ານການຊ່ວຍ.